Арбитраж Москвы в апреле 2015 года признал Пугачева и еще троих топ-менеджеров МПБ виновными в совершении действий, приведших к банкротству банка, в частности в выдаче заведомо невозвратных кредитов и выводе ликвидных активов. Суд по заявлению Агентства по страхованию вкладов обязал Пугачева выплатить
75,6 млрд рублей, в том числе около 68,5 млрд — солидарно с последней главой банка Мариной Илларионовой и около 7,2 млрд — солидарно с двумя другими бывшими председателями правления Александром Диденко и Алексеем Злобиным.